Quá trình phát triển phôi hay quá trình phôi được hình thành và phát triển. Ở động vật có vú, thuật ngữ này chủ yếu đề cập đến giai đoạn đầu của sự phát triển trước khi sinh, trong khi thuật ngữ bào thai và sự phát triển của bào thai mô tả các giai đoạn sau.
Quá trình hình thành phôi bắt đầu bằng sự thụ tinh của trứng (noãn) bởi một tế bào sinh tinh (tinh trùng). Sau khi được thụ tinh, trứng được gọi là một hợp tử, một tế bào lưỡng bội. Hợp tử trải qua quá trình phân bào mà không có sự tăng trưởng đáng kể (một quá trình được gọi là sự phân cắt) và sự biệt hóa tế bào, dẫn đến sự phát triển của một phôi đa bào.
Mặc dù quá trình phát sinh phôi xảy ra trong cả quá trình phát triển của động vật và thực vật, nhưng bài viết này đề cập đến những đặc điểm chung giữa các loài động vật khác nhau, với một số nhấn mạnh về sự phát triển phôi của động vật có xương sống và động vật có vú.
Noãn nói chung là không đối xứng, với một "cực động vật" (ngoại bì và trung bì tương lai) và một "cực thực vật" (nội bì tương lai). Nó được bao phủ bởi các phong bì bảo vệ, với các lớp khác nhau. Lớp bì đầu tiên - lớp tiếp xúc với màng trứng - được làm bằng glycoprotein và được gọi là màng sinh tinh (zona pellucida ở động vật có vú). Các đơn vị phân loại khác nhau thể hiện các bao tế bào và tế bào khác nhau bao bọc màng noãn hoàng.
Sự thụ tinh (còn được gọi là "thụ thai", "thụ tinh" và "tổng hợp") là sự hợp nhất của các giao tử để tạo ra một sinh vật mới. Ở động vật, quá trình này liên quan đến việc tinh trùng kết hợp với trứng, cuối cùng dẫn đến sự phát triển của phôi thai. Tùy thuộc vào loài động vật, quá trình này có thể xảy ra bên trong cơ thể con cái trong trường hợp thụ tinh bên trong, hoặc bên ngoài trong trường hợp thụ tinh bên ngoài. Trứng được thụ tinh được gọi là hợp tử.
Tại một số thời điểm sau khi các lớp khác nhau của phôi được xác định, quá trình hình thành cơ quan bắt đầu. Giai đoạn đầu tiên ở động vật có xương sống được gọi là neurulation, nơi đĩa thần kinh gấp lại để tạo thành ống thần kinh (xem ở trên). Các cơ quan hoặc cấu trúc phổ biến khác xuất hiện vào thời điểm này bao gồm tim và măng non (cũng ở trên), nhưng cho đến nay sự phát sinh phôi không tuân theo một mô hình chung giữa các đơn vị phân loại khác nhau của giới động vật.
Ở hầu hết các loài động vật, sự phát sinh cơ quan cùng với sự phát sinh hình thái sẽ tạo ra ấu trùng. Sự nở ra của ấu trùng, sau đó phải trải qua quá trình biến thái, đánh dấu sự kết thúc của quá trình phát triển phôi.