Chúng đại diện cho sự kết hợp của hai hoặc nhiều axit amin thông qua kết nối giữa gốc và các peptit. Trong các sản phẩm và protein, các liên kết này liên quan đến liên kết peptit và là kết quả của phản ứng giữa nhóm cacboxyl với nhóm amin của một loại khác, với sự loại bỏ một phân tử nước.
Các peptide trái phiếu (-CO-NH-) thường được biểu diễn dưới dạng một liên kết đơn. Tuy nhiên, không có, có một số đặc điểm gần đúng như một liên kết đôi. Vì nitơ có độ âm điện nhỏ hơn oxy nên liên kết CO có 60% tính chất liên kết đôi trong khi liên kết CN là 40%. Do đó, liên kết CO và NC của liên kết peptit có đặc điểm trung gian giữa liên kết đơn và liên kết đôi. Trên thực tế, khoảng cách giữa các nguyên tử đo được trong liên kết CO và CN là trung gian giữa các liên kết đơn và liên kết đôi. Sự sắp xếp nguyên tử này được ổn định bởi sự cộng hưởng, để sáu nguyên tử tham gia vào việc hình thành liên kết peptit được chứa trong cùng một mặt phẳng.
Một hệ quả quan trọng khác của hiện tượng cộng hưởng là nó làm tăng độ phân cực của liên kết peptit và thiết lập mômen lưỡng cực (hình bên phải trong bảng trên). Vì lý do này, mỗi liên kết peptit có thể tham gia vào hai liên kết hydro. Ở một trong số chúng, nhóm -NH- đóng vai trò là chất cho hydro và ở nhóm còn lại, nhóm -CO- hoạt động như chất nhận hydro. Đặc tính này góp phần đáng kể vào sự gấp ba chiều của protein, như chúng ta sẽ thấy ở phần sau.
Bản chất từng phần của liên kết đôi ngăn cản sự quay tự do của liên kết tham gia các nguyên tử C và N trong liên kết peptit. Độ cứng này của liên kết đôi hạn chế khả năng cấu tạo của các peptit. Có hai cấu hình có thể có:
- Cấu hình Cis: hai Ca ở cùng phía của liên kết đôi.
- Cấu hình trans: hai Ca nằm ở một phía khác nhau của liên kết đôi.
Cần lưu ý rằng, nói chung, liên kết peptit được biểu diễn dưới dạng liên kết đơn. Trong mọi trường hợp, nó có một số đặc điểm làm cho nó gần với một liên kết đôi. Đó là lý do tại sao các chuyên gia thường đề cập rằng liên kết peptit có các đặc tính đặt nó ở nửa giữa liên kết đơn và liên kết đôi.
